Evaluating the Methods of DNA Extraction from Nails Samples

Authors

Tahani Mansi Al-Onazi

Keywords:

DNA Extraction, Nails Samples, Biological Samples, Organic Extraction Method, QIAGEN Extraction Kits

Synopsis

This book deals with DNA extraction from nails samples. This extraction is of great importance. It provides analytical data on DNA in multiple criminal fields. The latter permits the examiner the opportunity to obtain an adequate amount of DNA to achieve this purpose.

The book comprises five chapters.

Chapter one includes an introduction to the study. It elaborates questions, objectives, and importance of the study.

The second chapter expounds the theoretical background of the study through the following:

. Theoretical framework.

. Previous studies.

The third chapter reviews the methodological procedures of the study. It includes the following: location of the study; study samples; collection of standard samples; design of empirical processes; DNA extraction of nails samples; dissolving nails in sodium hydroxide solution of (2mM) concentration; quantification of DNA; multiplication of extracted DNA; and display of genetic traits.

The fourth chapter presents and analyses the study data and offers its findings. It includes the following: study of the effects of age; nails polish; extraction methods on the Loci without protocol amendments; extraction method on Loci after nails dissolution.

Chapter five includes findings and recommendations.

Among the most important findings, the following are prominent:

. Nails from biological samples can provide a good source of DNA.

. Organic extraction enables obtaining a larger amount of DNA.

Among the recommendations of the study, the following are salient:

. Reliance should be on the organic method of extraction to obtain DNA from nails especially in the event of its meager amount of provision.

. Using sodium hydroxide in the extraction of DNA from nail samples should be avoided, if the quantity of nails sample is very limited. This is due to its negative effect on the amount of extracted DNA.

أولًا: المراجع العربية

البكري، غالب حمزة (1991م)، مبادئ الهندسة الوراثية، الرياض: جامعة البصرة.

الجمل، أحمد (2003م)، البصمة الوراثية ودورها في الإثبات الجنائي، المجلة الجنائية القومية، المجلد السادس والأربعون، العدد الثالث، ص 85، مصر.

الجندي، إبراهيم صادق (2000م)، الطب الشرعي في التحقيقات الجنائية، أكاديمية نايف العربية للعلوم الأمنية، الرياض: مركز الدراسات والبحوث.

الجندي، إبراهيم صادق والحصيني حسين حسن (2001م)، البصمة الوراثية كدليل فني أمام المحاكم، مجلة البحوث الأمنية، العدد 19، كلية الملك فهد الأمنية، الرياض: مركز الدراسات والبحوث.

الحنيطي، عبد الرحيم (1999م). استخدام الهندسة الوراثية في التعرف على الهوية، محاضرة، أكاديمية نايف العربية للعلوم الأمنية، الرياض: معهد التدريب.

أبو حوا، طارق عبد الله محمد (2005م)، الانعكاسات القانونية للإنجاب الاصطناعي ـ دراسة مقارنة، كلية الحقوق، جامعة المنصورة.

خليفة، إلهام (2013م)، الآثار المادية المتناثرة في مسرح الجريمة مفهومها وأنواعها وكيفية تعامل الخبراء الفنيين معها، مجلة الندوة للدراسات القانونية، العدد الأول.

الدخيل، عبد العزيز بن عبد الله (2010م)، أهمية الفحوص الوراثية في قضايا النسب والقضايا الجنائية، كلية الملك فهد الأمنية، الرياض: مركز البحوث والدراسات.

رفعت، أحمد محمد (2014م)، التقنيات العلمية في البصمة الوراثية، الرياض: جامعة نايف العربية للعلوم الأمنية.

السويلم، حمد بن عبد الله (2011م)، انعكاسات استخدام المادة الوراثية وتأثيراتها المحتملة على الأمن الوطني، الرياض: جامعة نايف العربية للعلوم الأمنية.

عابد، عبد الحافظ عبد الهادي (1991م)، الإثبات الجنائي بالقرائن، دار النهضة العربية، دون بلد النشر.

عاشور، محمد أنور (1996م)، المبادئ الأساسية في التحقيق الجنائي العملي، القاهرة: عالم الكتاب.

عبد الفتاح، مراد (1991م)، التحقيق الجنائي الفني والبحث الجنائي. (ط2)، المكتب الجامعي الحديث، دون بلد النشر.

القواسمي، بسام محمد (2010م)، أثر الدم والبصمة الوراثية في الإثبات في الفقه الإسلامي والقانون. (ط 1)، الأردن: دار النفائس للنشر والتوزيع.

مرسي، عبد الواحد إمام (1996م)، الموسوعة الذهبية في التحريات، لبنان: عالم الفكر.

المعايطة، منصور عمر(2000م)، الأدلة الجنائية والتحقيق الجنائي. (ط1)، عمان: مكتبة دار الثقافة.

ـــــــــــــ. (2007م)، الطب الشرعي في خدمة الأمن والقضاء - الأدلة الجنائية ودورها في القضاء، الرياض: جامعة نايف العربية للعلوم الأمنية.

المهدي، السيد (1993م)، مسرح الجريمة ودلالته في تحديد شخصية الجاني، الرياض: المركز العربي للدراسات الأمنية والتدريب.

ياسين، عقيل عيد والسلطاني يحيى كاظم (1999م)، أساسيات الوراثة الخلوية الطبية، عمان: دار الفكر.

ثانيًا: المراجع الأجنبية:

Anderson T.D., Ross J.P., Roby R.K., Lee D.A.and Holland M.M.(1999), A validation study for the extraction and analysis of DNA from human nail material and its application to forensic casework, J Forensic Sci, 44: 1053–1056.

Andrew S. Wilson and M. Thomas P.(2007), Gilbert. Forensic Human Identification - An Introduction, CRC Press, pg 147 to 163.

Applied Biostems. (2012), Quanitifiler® Human DNA Quantification Kit and Quantifiler® Y Human Male DNA Quantification Kit. User Manual

Applied Biosystems (2003). GeneMapper ID Software version 3.2, Human Identification Analysis. User Guide No: 4338775C, rev. C

Applied Biosystems.(2012), AmpFISTR® Identifiler® plus PCR Amplification Kit. User’s Guide

Benecke, L. (1996), Expert insect identification in case of decomposed bodies. Arch Kriminol. 198: 99 - 109.

Berker, J. Andre and Baran R. (2007), Review Article: Nail biology and nail science. Int. J. Cosmetic Sci, 29, 241–275.

Bio - Rad laboratories (2006), Chelex® 100 product insert. Brima E.I. Haris P.I. Jenkins R.O Polya D.A. Gault A.G. Harrington C.F. (2006), Understanding arsenic metabolism through a comparative study of arsenic levels in the urine, hair and fingernails of healthy volunteers from three unexposed ethnic groups in the United Kingdom. Toxicology and Applied Pharmacology, 216 122- 130.

Brownlow RJ, Dagnall KE, Ames CE (2012), A comparison of DNA collection and retrieval from two swab types (cotton and nylon flocked swab) when processed using three QIAGEN extraction methods. J Forensic Sci., 57(3):713- 7.

Butler, J. (2005), Forensic DNA Typing: Biology, Technology and Genetics of STR Markers, 2nd ed., Academic Press, San Diego, p. 38.

Butler, J.M. (2001), Forensic DNA Typing: Biology and Technology behind STR Markers. Academic Press, London, 335 pages

Cabral, A., Berger, T.H., Middag - Broekman, J.H. and Boon, M.E (2006), Unequivocal morphological diagnosis of fungi in morphologically abnormal nails. Histopathology 48, 862–867.

Cervantes J. (2004), HLA class II allele typing using DNA obtained from human fingernail clipping material, Rev Invest Clin, 56: 341–344.

Cline R.E.,. Laurent N. M. and Foran D. R. (2003), The Fingernails of Mary Sullivan: Developing Reliable Methods for Selectively Isolating Endogenous and Exogenous DNA from Evidence. J Forensic Sci., 48 (2): 1- 6.

Comey, C. T. (1994): DNA extraction strategies for amplifiedfragment length polymorphism analysis. J Forensic Sci, 39 (5): 1254-1269.

Conner J. M. and Ferguson S. M. A. (1991), Nucleic AcidStructure and Function, In: Essential Medical Genetics, 3rd ed.,Blackwell Scientific Publication, London & Edinburgh

Daniel C.R., Piraccini B.M., Tosti A. (2004), The nail and hair in forensic science, Journal of American Academy of Dermatology,, 50: 258–261.

Demirci S. and Dogan K.H. (2015), Death Scene Investigation from the Viewpoint of Forensic Medicine Expert. Forensic Medicine – From Old Problems to New Challenges. www.intechopen.com. Retrieved on 1/3/.

Doncker, P. and Pie´rard, G.E. (1994), Acquired nailbeading in patients receiving itraconazoleaanindicator of faster nail growth? A study using opticalprofilometry. Clin. Exp. Dermatol. 19, 404–406

Endris R., Poetsch - Schneider L.(1985), Value of human lip lines and nail striations in identification, Archives of Criminology, 175: 13–20.

Gahr, B.and Kleemann WJ. (2004). Examinations of surviving victims and aggressors of physical violence. Presented at the European Colloquium of Forensic Medicine at the Centre of Health Care Responses to Violence, Bordeaux, France.

Glasel J. (1995): Validity of nucleic acid purities monitored by260280/ absorbance ratios. BioTechniques 18 (1): 62–63.

Gresham G.L., Groenewold G.S., Bauer W.F., Ingram J.C.(2000), Secondary ion mass spectrometric characterization of nail polishes and paint surfaces, Journal of Forensic Science, 45: 310–323.

Hebda LM, Doran AE, Foran DR. (2014), Collecting and analyzing DNA evidence from fingernails: a comparative study. J Forensic Sci. 59 (5):1343- 50. Higuchi R., Beroldingen C. H., Sensabaugh G. F. &Erlich H. A. (1998): DNA Typing from Single Hairs. Nature, 332, 543- 548.

Hoff - Olsen, P., B. Mevag, E. Staalstrom, B. Hovde, T. Egeland and B. Olaisen B. (1999): Extraction of DNA from decomposed human tissue: An evaluation of five extraction methods for short tandem repeat typing. Forensic SciInt 105 (3): 171–183

Hogervorst JG, Godschalk RW, Van den Brandt PA, Weijenberg MP, Verhage BA, Jonkers L, Goessens J, Simons CC, Vermeesch JR, van Schooten FJ, Schouten LJ. (2014), DNA from nails for genetic analyses in large - scale epidemiologic studies. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. Dec;23(12):2703- 12. doi: 10.1158/1055- 9965.EPI - 14-0552.

Inman K. and Rudin N. (1997): An Introduction to Forensic DNA Analysis. CRC Press, Inc., New York.

Ishida K. Bao - Li Zhu, Shigeki Sakoda, Li Quan, Shigeki Oritani, Masaki Q Fujita, Hitoshi Maeda (2000), Significance of DNA analysis for determination of ABO blood groups from hair and nail of decomposed human remains: a comparison with phenotyping by the absorption - elution method, Journal of Legal Medicine (Tokyo), 2: 212–215.

Janisch، S., Meyer, H, Germerott, T., Albrecht, UV, Schulz, Y, Deberti, AS. (2010). Analysis of Clinical Forensic Examination Reports on Sexual Assault. Int J Legal Med., 124 (3): 227- 235.

Joshua Park, Debbie Liang, Jung Woo Kim, Yongjun Luo, Taesheng Huang, Soo - Young Kim, Seong - Sil Chang.(2012), Nail DNA and Possible Biomarkers: A Pilot Study. J Prev Med Public Health;45;235- 243.

Kaneshige T. Takagi K, Nakamura S, Hirasawa T, Sada M, Uchida K. (1992), Genetic analysis using fingernail DNA, Nucleic Acids Res, 20: 5489–5490.

Keeton, W.T. and Gould, J.L. (1986), Biological Science, 4th edn. Norton, New York.

Midgley G. and Moore M.K.(1996), Nail infections, Dermatol Clin, 14: 41–49.

Nakanishi, A., Moriya, F., Hashimoto, y. (2003), Effects of environmental conditions to which nails are exposed on DNA analysis of them, Journal of Legal Medicine,, 5: 194–197.

Nakashima M, Tsuda M, Kinoshita A., Kishino T, Kondo S, Shimokawa O,(2008),Precision of high - throughput single - nucleotide polymorphism genotyping with fingernail DNA: comparison with blood DNA. Clin Chem;54:1746- 8.

Oikawa M, Kuniba H, Kondoh T, Kinoshita A, Nagayasu T, Niikawa N, (2010), Familial brain arteriovenous malformation maps to 5p 13- q14. 15q 11- q13 or 18p11; linkage analysis with clipped fingernail DNA on high - density SNP array. Eur J Med Genet;53:244-9.

Oz C. and Zamir A.(2000), An evaluation of the relevance of routine DNA typing of fingernail clippings for forensic casework, Journal of Forensic Science,, 45: 158–160.

Palmeri A., Pichini S., Pacifici R., Zuccaro P., Lopez A.(2000), Drugs in nails physiology, pharmacokinetics, and forensic toxicology, Clinical Pharmacokinetics, 38: 95–110.

Parmar Pragnesh, Gunvanti B. Rathod (2012). Forensic Onychology: An Essential Entity against Crime. J Indian Acad Forensic Med, 34 (4): 355- 357.

QIAamp® DNA Mini and Blood Mini Handbook (2010): DNA purification from Blood or body Fluids (Spin protocol) Qiagen 3rd ed. P 17,2729 Sambrook J. and Russell G. (2001): Molecular Cloning: A Laboratory Manual (3rd ed.). Cold Spring Harbor Laboratory Press ISBN 9784-577- 87969 - 0 Schneider. P.M. (1997), Basic issue of forensic DNA typing. Forensic science international 88, 17- 22.

Sweet D., Lorence M., Valenzuela A., Lorente J. A. & Alvarez J.C. (1996): Increasing DNA Extraction Yield From Saliva Stains with a Modified Chelex Method. Forensic Sci. International, 83: 167- 177.

Tahir M.A. and Watson N. (1995), Typing of DNA Hla - Dq - Alpha alleles extracted from human nail material using polymerase chain - reaction, Journal of Forensic Science, 40: 634–636.

Tataurov AV.; You Y., and Owczarzy R. (2008): Predicting ultraviolet spectrum of single stranded and double strandeddeoxyribonucleic acids. Biophys. Chem. 133 (170–66:)3.

Weismann, K.J.H.S. (1977), Beau and his descriptions of transverse depressions on nails. Br. J. Dermatol. 97,571–572.

Willard, J.M.,. Lee, D.A. and Holland. M.M. (1998): Recovery of DNA for PCR amplification from blood and forensic samples using a chelating resin. Methods of Molecular. - Biology 98: 918.

Cover photo

Published

01-March-2017

Details about this monograph

ISBN-13 (15)

978-603-8116-91-3

Date of first publication (11)

2017-03-01

Physical Dimensions

17cm x 24cm x 0.8cm